Caso não queira efetuar o fullbackup de toda a conta e sim de apenas um diretório, indicamos um procedimento feito também no cPanel através do Gerenciador de Arquivos. Nesse exemplo estaremos efetuando o backup do diretório public_html/ .

Entre no seu cPanel e no menu "Files" procure a opção "File Manager":

Selecione o diretório que deseja compactar e clique com o botão direito, em seguida "Compress":

Selecione o tipo de compactação que desejar, e também em qual local o backup será gerado. Não indicamos que seu backup fique na pasta public_html/ por questão de segurança. Nesse caso, deixaremos no home do usuário:

Após isso o Backup será gerado. Geralmente em poucos minutos, pois depende da quantidade de arquivos e espaço em disco total da pasta